台湾政府方不对设备本身进行认证,设备管理由代检业的第三方实验室承担,而环保署下属的环境检验所会对代检业进行资质考核。第三方实验室会去企业现场监测排放数据,并与企业在线监测的结果做比对,如果结果在偏差内,环保署接受企业申报的数据。 对于非常重要的污染源,在线监控结果会直接传输至环保局,申报系统会自动计算小时平均值,将结果与第三方实验室监测结果比对,如果超过就需要进行处罚。为避免企业作弊情况的发生,台湾环保署要求企业将原始监测数据保存2年。若上传资料与原始数据不一致也会受到严重处罚。